Appena uscita dalla sua recente sconfitta nella Battaglia di Cane Maggiore, la Regina Oscura decide di sfogare la sua rabbia sui suoi acerrimi nemici, i Battletoads. I Battletoads e il loro mentore, Professor T-Bird, stanno attualmente scortando la Principessa Angelica a casa del padre, l'Imperatore Terran. Durante una sosta, Pimple porta Angelica a fare un giro sul Toadster, ma il veicolo e i suoi occupanti vengono inghiottiti dalla nave della Regina Oscura, la Gargantua, e portati alla sua torre sul pianeta Ragnarok. Rash e Zitz vengono rapidamente inviati sulla superficie di Ragnarok per salvare i loro amici, inconsapevoli dei pericoli che li attendono, ma disposti a rischiare tutto per la loro missione di salvataggio.