It Came From the Desert è un gioco d'azione-avventura che trae ispirazione dai numerosi film horror di culto di serie B degli anni '50 e '60, in particolare il film del 1954 Them!. Il giocatore interpreta il Dr. Greg Bradley, un geologo e il nuovo residente in città. Desideroso di soddisfare la sua mente scientifica, Bradley si mette a esaminare il luogo dell'impatto di un misterioso meteorite, ma ciò che trova non è affatto ciò che stava cercando. Il gioco si svolge in tutta l'ambientazione di Lizard Breath, e ci sono diversi tipi di azione e interazione. La parte avventurosa del gioco è molto lineare, guidando il giocatore in una sequenza abbastanza definita di sezioni di azione. Queste includono sparatutto in prima persona contro insetti, sparatutto dall'alto a scorrimento e una sequenza di inseguimento.