Un "Principe" di Persia stava tornando a casa da un viaggio all'estero, si perse nella tempesta di sabbia e finì nel territorio proibito. Il Principe incontrò alcuni mostri e trovò una donna catturata da loro. Dopo diversi incontri con la donna, lei si presentò come Elika e iniziarono a viaggiare insieme. Elika cercò il seme, nella speranza che salvasse il suo regno. Elika suggerì di seguire lo Spirito Magico fino al seme. Il Cacciatore raggiunse Elika, ma il Principe intervenne e lo scacciò. Elika disse al Principe che il cacciatore doveva essere ucciso, e usarono Diamond Dragon per volare verso nord dove abitava il Cacciatore. Durante il viaggio, Elika disse che suo padre era da biasimare per tutta la corruzione. Trovarono il Cacciatore, che rapì Elika; il Principe lo seguì e lo uccise. Il Cacciatore possedeva anche il seme che Elika stava cercando. Il seme dall'Albero della Vita. Elika non incolpò davvero suo padre per aver distrutto l'Albero della Vita, poiché era afflitto dal lutto dopo aver perso sua moglie, e quando perse qualcun altro, riportò in vita quella persona usando l'Albero della Vita. Dopo che il padre di Elika distrusse l'Albero della Vita, quattro creature elementali assorbirono i semi. Elika aveva bisogno di quattro di questi semi e si misero in viaggio verso il canyon dove viveva la prossima creatura. La seconda creatura elementale che incontrarono fu il Polpo. Dopo aver sconfitto il Polpo e ottenuto il seme, volarono verso l'osservatorio sul Diamond Dragon per cercare la Child Queen, ma la Child Queen li attaccò durante il volo invece. Riuscirono a respingere la Child Queen, e poi la rintracciarono a terra e la sconfissero per sempre. Andarono a cercare l'ultimo seme nelle mani del Guerriero, residente nella fenditura di lava. Elika rivelò che era lei la persona che suo padre aveva resuscitato. Il Principe stava iniziando a provare sentimenti per Elika, e cercò di convincerla a non sacrificarsi e a trovare un'altra via. Ma Elika non pensava che esistesse un'altra via e diede la propria vita per ristabilire l'Albero della Vita.