Sequel a Shikigami no Shiro, SS2 è uno sparatutto a scorrimento verticale con elementi di fantascienza. Come in molti giochi del genere, il gioco ti mette al controllo di un piccolo velivolo da combattimento mentre cerchi di avanzare attraverso diversi livelli pieni di astronavi nemiche che si lanciano all'attacco in schemi differenti. Il gioco presenta sette personaggi distinti dotati di poteri psichici (che si manifestano in-game come attacchi di tipo bomba e altre mosse speciali) e combattenti unici, e propone una modalità storia per ciascun personaggio, con dialoghi differenti e sequenze della trama per ogni scontro con un boss. È presente anche un sistema di armi simile a quello di Psyvariar, in cui puoi aumentare la potenza e la velocità di fuoco sfiorando i proiettili in arrivo.