In modo simile ad altre simulazioni storiche di Koei, il giocatore inizia la partita scegliendo innanzitutto uno scenario. Gli scenari includono: 1. Yoritomo Pone le Basi di Kamakura (ottobre 1180): le conquiste di Kiyomori, l'esilio e l'ascesa di Yoritomo all'interno degli Hōjō 2. Yoshinaka Prende la Capitale (luglio 1183): le forze insurrezionali di Yoshinaka si scontrano con Yoritomo, l'ascesa di Munemori al vertice degli Heike 3. Restaurazione degli Heike nel Mare Occidentale (ottobre 1184): situazione della guerra dopo la Battaglia di Ichi-no-tani; gli Heike hanno perso proprietà e si ritrovano bloccati nell'ovest 4. Yoshitsune Stermina gli Avversari di Suo Fratello (ottobre 1185): Battaglia di Dan-no-ura, contesa tra Yoritomo e Yoshitsune in Oshu Gli Heike sono potenti nei primi due percorsi narrativi, ma i Genji avranno un chiaro vantaggio nell'altra metà. Il clan Fujiwara rimane ingegnoso ma ambivalente in ogni scenario. Come nelle prime versioni di Nobunaga's Ambition o di Romance of the Three Kingdoms, le animazioni e i duelli possono essere disattivati. Gli eventi storici vengono attivati automaticamente in base alla data di gioco, ma il giocatore può impedirne attivamente il verificarsi. Ad esempio, uccidere Yoritomo prima che Kiyomori cada in malattia non farà mai scattare la morte storica di Kiyomori nella prima trama. Il tempo trascorso in ciascun scenario è illimitato, terminando solo quando il giocatore avrà perso o ottenuto la vittoria. In qualsiasi momento, il giocatore può scegliere di lasciare le azioni della propria fazione all'IA del gioco.