Jagged Alliance combina elementi di strategia a turni e di ruolo in un'avventura avvincente a tema mercenario. Ambientata sull'isola fittizia Metavira, i giocatori sono incaricati dal dottor Jack Richards e da sua figlia Brenda di riconquistare il controllo sugli alberi medicinali Fallow dallo spietato Santino. I giocatori devono reclutare e gestire una squadra di mercenari da un roster diversificato di 60 personaggi unici, ciascuno con personalità distinte, abilità e dialoghi doppiati. Il gioco offre combattimento tattico e una giocabilità non lineare, che consente ai giocatori di affrontare le missioni con libertà strategica. Con tre livelli di difficoltà e una funzione di replay, Jagged Alliance mette alla prova i giocatori affinare le proprie tattiche e sfruttare le debolezze nemiche. Questa fusione di elementi di strategia e RPG immerge i giocatori in un conflitto ad alto rischio, in cui ogni decisione può cambiare le sorti della battaglia sull'isola contesa di Metavira.