All'interno del corpo umano, una guerra costante infuria tra le cellule virali invasive e i meccanismi di difesa dell'organismo. La maggior parte delle volte il corpo respinge facilmente questi predoni, ma di tanto in tanto compare una versione più forte - mutante - del virus che mette le difese dell'organismo a rischio di essere sopraffatte. Quando ciò accade usiamo meccanismi artificiali per proteggere l'organismo e Vaxine ti mette al controllo dei dispositivi più recenti. Le cellule invasive appaiono e si legano gradualmente tra loro finché non sono abbastanza forti da attaccare certe cellule chiave del corpo. Se gli invasori non vengono eliminati prima che si attacchino a queste cellule, non solo le distruggeranno, ma useranno anche le loro parti costitutive per crearne di nuove. Se tutte queste cellule chiave del corpo venissero distrutte, la vita non potrebbe più essere sostenuta, e - inevitabilmente - il gioco sarebbe finito.