Basato sugli eventi del libro Maze of Shadows. Mentre viaggi nell'oltretomba di Mata Nui nei panni dei Toa Metru, combatterai i Rahi, sbloccherai nuovi poteri e aiuterai Nokama ottenendo protodermis energizzato per la pianta di Karzahni e una radice curativa per Nokama, che è stata ferita mortalmente. A differenza della maggior parte degli altri giochi portatili di BIONICLE, Maze of Shadows è semi-canonico, con alcuni aspetti che sono canonici, mentre altri aspetti non lo sono.