L'iterazione su Game Boy Advance della serie Custom Robo. Custom Robo GX è una versione per GBA esclusiva per il Giappone di Custom Robo. Mantiene il classico gameplay ibrido RPG della serie, ma cambia il sistema di combattimento per adattarsi alle limitate capacità della GBA. I Robos possono ancora essere personalizzati nello stesso modo dei giochi su console (Body, Gun, Bomb, Pod, Feet), ma i combattimenti si svolgono su un piano bidimensionale in gravità zero. C'è ancora puntamento automatico, e i Robos hanno le stesse modalità di fuoco delle versioni per console. Diverse arene presentano ostacoli, e i Robos hanno mosse di scatto per muoversi intorno ad essi in modo più efficace. In generale, un Robo è basato sul suo equivalente in 3D, quindi un Robo lento e potente continuerà ad essere lento e potente. Questo gioco era originariamente pianificato per essere il primo gioco di Custom Robo rilasciato in America, ma Nintendo scelse la versione per GameCube invece.