Il quarto capitolo della serie Mega Man Battle Network arriva in due versioni, Red Sun e Blue Moon, ciascuna con nemici differenti, chip di battaglia, anime e personaggi. Ancora una volta, assumi il ruolo di Lan mentre lui e il suo amico, Mega Man.exe, lottano per liberare Internet dai virus e da altri nemici del cyberspazio. A differenza dei giochi precedenti della serie, Mega Man Battle Network 4 si concentra su un sistema a torneo in cui i giocatori incontrano una varietà di nemici che devono essere sconfitti. Un nuovo sistema Soul Unison permette a Mega Man di trasformarsi nei suoi nemici sconfitti.