Una delle invenzioni del Professore ha involontariamente lacerato un grande buco nel tessuto dello spazio-tempo, creando un portale tra Rhynoc Lands e Dragon Realms. Ripto, naturalmente, ne sta approfittando appieno, poiché inizia a inviare le sue armate di rhynocs attraverso il portale per seminare caos. Spyro deve trovare, in qualche modo, una via per chiudere il portale prima che Ripto riesca a prendere il controllo dei Dragon Realms.