Dopo che un gigantesco mostro alimentato elettricamente, chiamato The Crackler, cominciò ad attaccare New York, Godzilla andò a combatterlo mentre Randy Hernandez cercava un modo per fermarlo. Godzilla lo affrontò e riuscì a sconfiggerlo quando fu indebolito dal suo creatore inconsapevole che finalmente affrontò le sue emozioni. Dopo di che, Niko Tatopoulos chiamò il Maggiore Anthony Hicks per dirgli di smettere di attaccare Godzilla, che aveva appena salvato la città, ma Hicks rivelò che nessuno aveva ordini di attaccare Godzilla. Fu inseguito in acqua da un elicottero, e sbarcò su un'isola. Sull'isola, Godzilla fu attaccato da ulteriori veicoli militari e da una popolazione di Api Giganti Mutanti, e alla fine affrontò la loro Regina. Dopo aver sconfitto le Api Mutanti, H.E.A.T. notò che le risorse militari stavano ancora attaccando Godzilla, e decisero di continuare ad affrontarle per giungere alla loro fonte. Mentre Godzilla proseguiva, fu incontrato da ulteriori mezzi militari e Cyber Flies prima di affrontare un enorme carro armato. Dopo di ciò, H.E.A.T. iniziò a indagare sul catrame sulla spiaggia che ritenevano fosse collegato alla scomparsa di diversi nuotatori. Poi furono attaccati da un Mutant Giant Squid, che Godzilla sconfisse, prima che arrivassero altri attacchi, insieme all'esercito. Alla fine incontrarono alcuni calamari che non erano bruciati dalle Fire Balls di Godzilla, ma racchiusi nel catrame digestivo che avevano trovato in precedenza. Prima che potessero riflettere troppo su cosa stesse davvero creando il catrame, il Crustaceous Rex emerse e attaccò Godzilla. Mentre era in grado di usare il suo catrame per immobilizzare Godzilla, Godzilla riuscì a sconfiggerlo. Dopo aver notato che Godzilla stava agendo in modo molto iperattivo, H.E.A.T. fu contattata da Cameron Winter, che li accusò di intrusioni prima di ammettere che era lui dietro i singolari attacchi militari a Godzilla per mettere alla prova le armi di Solstice Technologies, e che stava usando una macchina per controllare Godzilla. N.I.G.E.L. fu in grado di smantellarlo, e Godzilla avanzò sull'isola e sconfisse versioni aggiornate del Solstice Helicopter e del Solstice Tank. Godzilla raggiunse quindi l'impianto Solstice Industries sull'isola e lo distrusse. Con il mistero su chi stesse attaccando Godzilla alle loro spalle, H.E.A.T. e Godzilla tornarono a New York City.