Roger viene convocato da Marvin nella sua fabbrica per prendere il suo atto di proprietà e ottenere il suo testamento da Jessica Rabbit, al fine di salvare Toontown dall'avidissimo Judge Doom. Subito dopo, Marvin viene freddato da un colpo attraverso la finestra del suo ufficio e ucciso. Mentre Roger incontra Jessica, lei viene rapita da entrambi gli scagnozzi donnole di Doom. Roger riceve aiuto da Eddie Valiant. Nel corso delle sue indagini, Roger affronta i weasels Stupid, Greasy, Psycho e Smarty e alla fine arriva alla mansione di Doom. Supera il complesso e affronta Doom, sconfiggendolo e distruggendo la sua Dip Machine.