Due alieni appassionati di funk, chiamati ToeJam e Earl, atterrano rovinosamente su un pianeta strano chiamato Earth dopo essersi scontrati con un meteorite. Ben presto si rendono conto di avere a che fare con un pianeta ostile, i cui abitanti folli faranno di tutto per mettere gli innocui alieni sei piedi sotto terra. Aiutati da alcuni terrestri amichevoli e da scatole degli oggetti casuali sparse in giro per il pianeta, ToeJam e Earl iniziano la loro avventura attraverso 25 livelli per trovare 10 pezzi della loro nave spaziale, così da poter tornare al loro pianeta natale Funkotron.