Dragon Quest VII racconta la storia di un giovane eroe, figlio di un pescatore di spicco nel villaggio di Pilchard Bay sull'isola Estard, l'unica massa di terra del mondo, e dei suoi amici in un mondo fantastico dall'atmosfera medievale. Partono per avventure attraverso il passato del mondo e imparano la sua storia. Scoprendo diverse terre nel passato e risolvendo i problemi, riappaiono sulla mappa del presente del gioco. La compagnia inizia la sua avventura quando l'eroe e Kiefer scoprono un frammento misterioso di una mappa che il padre dell'eroe riporta a casa da una battuta di pesca. Ulteriori indagini portano l'eroe a scoprire che il mondo in cui vive, che sembra consistere solo della sua piccola isola, un tempo conteneva molti continenti che in qualche modo sono stati sigillati. Collocando altri frammenti di pietra trovati lungo il viaggio sui pedestali nelle rovine di Estard, l'Eroe e i suoi amici vengono mandati in diverse terre nel passato, che il gruppo alla fine realizza. Una volta risolti i problemi nel passato delle zone interessate, i continenti riappaiono nel presente. Dopo che il mondo è stato restaurato, Orgodemir, il Demonlord, si traveste dall'Onnipotente e sigilla di nuovo diverse isole; questa volta anche Estard viene sigillata. Il gruppo parte per far rinascere gli spiriti elementali: Vento; Fuoco; Terra; e Acqua. Orgodemir viene quindi rivelato al mondo come il Demonlord, al quale afferma di averlo fatto per ingannare l'umanità. Orgodemir solleva allora la Cathedral of Blight; e con l'aiuto dello Skystone, la compagnia lo affronta in una battaglia finale.