In Nintendogs + Cats, inizi nel canile dove ti viene detto di scegliere un cane tra le numerose razze disponibili. Una volta selezionato, lo porti a casa e lo fai progredire finché non puoi insegnargli un nome. Una volta che gli hai dato un nome, devi insegnargli il comando di addestramento 'Siediti'. Poi, una volta completato, entri in uno stato simile a una sandbox in cui puoi fare acquisti, portare a spasso il tuo cane, giocare con lui o partecipare a gare. Nintendogs + Cats non ha una storia evidente e apparentemente nessuna fine chiara. Alcuni ritengono che l'obiettivo sia ottenere il 'Robodog Voucher' con la meccanica di riciclo collezionabile, o ottenere la maggiore quantità di contenuti sbloccabili con i 'Trainer Points'; altri ritengono che si tratti di vincere gare, ma in realtà spetta al giocatore decidere davvero quale sia la fine e come desidera giocare a Nintendogs + Cats.