Marvin The Martian ha sviluppato un'arma definitiva che gli permetterà finalmente di distruggere la Terra e, di conseguenza, di prendere il controllo dell'universo. Durante la dimostrazione dell'arma, un piccolo intoppo impedisce a Marvin di portare a termine il suo losco piano. L'arma è a corto di atomi, di cui si avvale per funzionare, così invia i suoi scagnozzi (tutti personaggi dell'universo Looney Tunes) a raccogliere atomi per alimentare la sua arma. Duck Dodgers viene informato dalla sua accademia delle imprese di Marvin e parte per trovare i cento atomi prima che Marvin possa farlo. Questo porta Dodgers e il suo compagno Cadet a muoversi tra quattro pianeti differenti, inclusa una grande nave pirata, per ottenere il vantaggio su Marvin.