Mario & Luigi: Bowser's Inside Story è il terzo gioco della serie Mario & Luigi. I giocatori controllano Mario e Luigi contemporaneamente nell'ambiente di piattaforma a scorrimento laterale del corpo di Bowser, controllando anche lo stesso Koopa King nel mondo dall'alto della Mushroom Kingdom. Simili a giochi come Earthbound, gli incontri con i nemici sono visti come nemici reali che i giocatori possono evitare o cercare di colpire in anticipo. Le vere battaglie sono una combinazione di attacchi basati su menu a turni e reazioni a tempo agli avversari durante lo scontro. Osservando come reagisce un nemico, puoi anticiparne l'attacco e evitarlo o contrattaccare.