Il ninja Ryu è tornato per vendicare la morte del padre e fermare il malevolo Ashtar. È passato un anno da quando Ryu ha affrontato per l'ultima volta il suo nemico giurato, e le attività nel profondo del regno delle tenebre continuano senza sosta. Ashtar, il malvagio signore che controlla segretamente Jaquio, è di nuovo in movimento, e spetta a Ryu, il "Ninja Dragone", fermarlo. Usa tutti i segreti del vero Ninjitsu, insieme agli emozionanti effetti speciali audio e visivi, e lasciati coinvolgere nel mondo fantastico di Ninja Gaiden II: The Dark Sword Of Chaos.