L'esplorazione spaziale umana è entrata in una nuova era. Su un pianeta alieno, una forma di vita simile a un essere umano, i Nemesis, è stata scoperta insieme a risorse preziose, e tra le due fazioni è iniziato uno scambio. All'inizio, i Nemesis erano visti come esseri pacifici, e sembrava che la Terra sarebbe entrata in una nuova era convivendo con loro. Tuttavia, la vera intenzione dei Nemesis era impadronirsi delle risorse della Terra e dominare l'umanità. Si sono infiltrati sulla Terra in modo astuto, nascondendosi in diverse parti della città e sferrando attacchi in momenti inaspettati. I Nemesis possedevano armamenti avanzati e armi biologiche potenti. L'umanità era impotente a resistere, e le principali città crollarono rapidamente. In questa crisi, un piccolo gruppo di sopravvissuti formò l'unità delle Forze Speciali Vega e iniziò a combattere contro i Nemesis. Attraverso ripetuti scontri, Vega rivela la sconvolgente verità sull'invasione dei Nemesis. Lo scopo dei Nemesis non era solo depredare risorse. Avevano un piano per distruggere l'ambiente della Terra e creare una nuova specie iniettando i loro geni nell'umanità. Appresa ciò, Vega avviò un'operazione audace. E dopo una feroce battaglia, riuscirono a mettere a segno un'incursione nella base dei Nemesis ed eliminare il loro leader. Tuttavia, l'invasione dei Nemesis è ancora in corso, e Vega si prepara per l'ultima battaglia con il destino dell'umanità in gioco.