Marth è il principe di Altea e un discendente diretto di Anri, il guerriero che uccise il drago Ombra Medeus. Tuttavia, dopo un attacco dal regno confinante di Dolhr, Marth è costretto a diventare un esule nella nazione vicina di Talis. Sua sorella Ellis viene tenuta in ostaggio dopo che suo padre è stato ucciso combattendo contro il malvagio sacerdote Gharnef. Con l'aiuto del cavaliere alteano Jagen, della Principessa talisiana Caeda e di altri, Marth intraprende una missione per trovare la spada sacra nota come Falchion e la Fire Emblem che gli permetterà di brandirla. Solo allora sarà in grado di affrontare Gharnef e il Medeus risorto, riconquistare il regno di Altea e salvare sua sorella.