Chiudi gli occhi e immagina… un sole rasserenante accompagnato dal suono delle onde che si infrangono dolcemente sulla riva. In alto, i gabbiani tracciano cerchi pigri in un cielo azzurro limpido. Questo è l’Isola Delfino. Lontano dal trambusto del Regno dei Funghi, questo resort sull'isola brilla come una gemma nelle acque di un mare meridionale. Mario, Peach e un entourage di Toads sono venuti all’Isola Delfino per rilassarsi e divertirsi. Almeno, questo era il loro piano… ma all’arrivo scoprono che le cose sono andate terribilmente storte... Secondo gli abitanti dell'isola, la persona responsabile del caos ha un naso tondo, un grosso baffo e un cappello… Cosa? Ma… questo suona come Mario!! Gli abitanti dell'isola dicono che il pasticcio di Mario ha inquinato l’isola e ha fatto sparire la loro fonte di energia, gli Shine Sprites. Ora Mario, ingiustamente accusato, ha promesso di pulire l’isola, ma... come? Niente paura! FLUDD, l’ultima invenzione di Gadd Science, Inc., può aiutare Mario a mettere in ordine l’isola, affrontare i cattivi e prestare un ugello in ogni tipo di situazione appiccicosa. Riuscirà Mario a pulire l’isola, catturare il cattivo e riabilitare la sua reputazione? È tempo di iniziare un’altra avventura di Mario!