Game: Jesus II Ambientato quattro anni dopo gli eventi del primo gioco, il gioco inizia a bordo della Callisto, una nave passeggeri in navigazione nel Mar Mediterraneo. Un oggetto proveniente dal cielo si schianta improvvisamente nelle vicinanze della Callisto e provoca un forte impatto. Kazuya Goshiki, un meccanico 3WD a bordo, viene tramortito dall'esplosione mentre è sul ponte. Quando si risveglia scopre che l'oggetto era una sorta di contenitore e che era stato recuperato dalla nave.