Il giocatore è Blender, il temerario leader dei Cosmo Keepers. È determinato a salvare la galassia dal malvagio ma carino Zooligans. Ha un enorme paio di orecchie che può usare come sonar (per capire dove andare in un livello), per volare per un breve periodo di tempo, o per colpire i nemici con la sua iconica mossa di giro. Nel gioco, usa Mini Bros. per aiutarlo. Hanno tutte abilità speciali diverse tra loro. Alcune possono essere usate per illuminare le zone buie, altre possono curare la salute di Blender, e altre ancora hanno altre funzioni.