Nei giochi, il giocatore veste i panni di un capitano (chiamato anche commodoro in alcune traduzioni) e gestisce una flotta marittima per partecipare a scambi, corsari privati, caccia al tesoro, esplorazione e pura pirateria. Sebbene la serie sia ampiamente aperta, esiste comunque una trama leggera che richiede al giocatore di seguire determinati percorsi, e discostarsi da tali percorsi potrebbe rallentare lo svolgimento della storia. I due protagonisti sono i seguenti: * Miranda Verte: avventuriera genovese che, pensando erroneamente che il cacciatore di tesori Pietro Conti le avesse chiesto la mano, parte per trovarlo. La sua ricerca porta infine a una trama relativa a una civiltà antica del Sud America, che era già stata toccata dall'avventura precedente di Pietro. * Salvador Reis: pirata e figlio adottivo di Hayreddin Reis (noto anche come Khayr ad-Din). La sua avventura lo vede emergere come uno dei pirati algerini, competere per il dominio con i clan pirati nemici e lottare anche per il potere all'interno del proprio clan.