Nel 2241, l'Arroyo primitivo subisce la peggiore siccità mai registrata. Di fronte alla calamità, l'anziano del villaggio chiede al discendente diretto del Vault Dweller, noto come il Chosen One, di intraprendere la missione di recuperare un Garden of Eden Creation Kit (GECK) per Arroyo. Il GECK è un dispositivo che può creare comunità fiorenti dalla landa post-apocalittica. Il giocatore, assumendo il ruolo del Chosen One, riceve nient'altro che la tuta del Vault Dweller, un dispositivo palmare RobCo PIP-Boy 2000, una borraccia d'acqua Vault 13, una lancia e qualche soldo per iniziare la sua missione.