Lo scenario omonimo si concentra sull'operazione di salvataggio di Kairi da parte di Sora. Assumendo una forma incorporea, Sora viaggia indietro nel tempo verso la battaglia tra i guardiani della Luce e l'Organizzazione, attraversando i cuori dei guardiani per raggiungere Kairi. Dopo aver attraversato i cuori di Ventus, Aqua, Terra e Roxas, Sora entra nel cuore del suo passato e cerca di evitare il destino di Kairi, ma fallisce. Tuttavia, Mickey rivela a Sora che Xehanort ha nascosto i frammenti di cristallo del cuore di Kairi come ultima risorsa. Sora trova cinque frammenti in Scala ad Caelum prima della battaglia finale del suo passato con Xehanort, e poi rintraccia i restanti due attraverso i cuori di Riku e di Mickey durante la battaglia dei guardiani contro le repliche di Xehanort, riportando Kairi. Dopo aver sconfitto le repliche fuse di Xehanort, Sora e Kairi si recano nel Mondo Finale per incontrare Chirithy, al quale Sora convince a tornare nel regno della Luce. Sora e Kairi visitano poi i mondi dei loro amici—riunendo Chirithy con il suo proprietario, Ventus, e ripristinando il cuore di Naminé—prima di tornare alle Isole del Destino, dove Sora scompare. «Limitcut Episode» è ambientato un anno dopo la scomparsa di Sora; i suoi alleati hanno da allora condotto una ricerca continua su di lui, mentre Kairi è entrata in stasi dopo essersi offerta come soggetto di test di Ansem the Wise per aiutare Sora. Durante una visita al Giardino Radiante, Riku analizza copie digitali di Sora e dei membri dell'Organizzazione programmati nel computer di Cid Highwind, sperando di scoprire indizi sul luogo in cui si trovi Sora attraverso le loro battaglie.