La storia del gioco ruota attorno a un minerale extraterrestre, Siberite, capace di catalizzare la fusione fredda e di fungere da carburante per un artefatto alieno. Siberite e l'artefatto - chiamato EON - sono scoperti da una spedizione statunitense in Russia durante la Prima Guerra Mondiale. EON si rivela essere una macchina del tempo capace di inviare oggetti nel passato, ma al momento della scoperta le riserve di Siberite sono esaurite e la ricerca si interrompe. Poi, nel nuovo millennio, vasti giacimenti del minerale vengono trovati in Siberia, e gli americani riescono ad estrarne una quantità sufficiente per viaggi nel tempo su piccola scala. Gli Stati Uniti elaborano un piano per inviare una piccola forza due milioni di anni indietro nel tempo. Lì estrarranno la Siberite e la trasporteranno oltre il Ponte terrestre di Bering verso l'Alaska, in ciò che un giorno sarà nelle mani degli Stati Uniti. Le migliori truppe vengono selezionate, messe al corrente e informate che si tratta di un viaggio di sola andata nel tempo. Questo porta a una nuova linea temporale in cui il minerale si trova in Alaska e gli Stati Uniti sono l'unica superpotenza indiscutibile grazie alla fonte inesauribile di energia. Qui la macchina del tempo non è stata trovata dagli Stati Uniti ma dai russi. L'URSS ribolle di fronte alla supremazia americana. La frustrazione si trasforma in rabbia quando gli scienziati sovietici trovano tracce di insediamenti americani e di Alaskite, la fonte del potere degli Stati Uniti, nella remota Siberia. Una spedizione sovietica viene inviata attraverso l'EON, qui chiamato TAWAR, per respingere i ladri americani e preservare ciò che è legittimamente loro.