Il gioco ruota attorno a un giovane di nome Daniel Garner, che è felicemente sposato con sua moglie Catherine. All'inizio del gioco, Daniel sta per portare Catherine fuori per una cena di compleanno. Mentre guidano verso la loro destinazione ad alta velocità, sotto una pioggia battente, Daniel distoglie lo sguardo dalla strada per guardare sua moglie e, mentre la sua attenzione è distratta, sbatte la loro auto contro un camion. Entrambi muoiono sul colpo nello scontro. Mentre Catherine riesce ad arrivare in Heaven e vi vive in armonia, Daniel è intrappolato in Purgatory. Un giorno, incontrando un complice chiamato Samael, gli viene detto che, per ricevere purificazione, deve uccidere quattro dei generali di Lucifer per impedire una guerra tra Heaven e Hell. Lucifer ha segretamente organizzato un enorme esercito che potrebbe sopraffare Heaven, prendendo possesso di Purgatory nel processo. Piccole porzioni dell'esercito stanno già iniziando la marcia. Con poche scelte a sua disposizione, Daniel accetta il compito. Con le forze dell'Hell che prendono possesso e corrompono varie parti del Purgatory, Daniel attraversa diverse e casuali fasi della storia all'interno del Purgatory, che vanno dall'antichità all'era moderna. Queste includono Medieval Europe, Babylon, the Crusades, 1800s e persino una time slice of modern industry.