Sono passati quattro anni dalla sconfitta dello Shaper avvenuta grazie all'Archfire. Durante quel periodo scienziati, draghi e inventori hanno cercato un modo per contrastare il misterioso deterioramento dei portali — invano. La rete dei portali è ora completamente crollata e le isole sono separate tra loro. I draghi e gli Shaikan fungono da unica connessione tra le razze, ma anche le loro risorse sono limitate. Ora, con le nazioni isolate l'una dall'altra, un nuovo nemico Nameless colpisce. Eo è completamente in balia degli aggressori provenienti dalle profondità demoniache. Nel mezzo di questo caos appare un nuovo eroe. Un semplice Shaikan e un membro della Mano, egli cerca disperatamente risposte ai suoi sogni profondamente inquietanti. Questa ricerca lo conduce alla casa ancestrale del suo popolo, Iron Fields, e alla montagna del Patriarca Ur. Gli anziani possono solo dirgli che i suoi sogni sono legati al suo destino, ma nulla di più. Al suo arrivo non trova altro che nuove domande: Chi sono queste creature demoniache che gli abitanti chiamano Nameless? Cosa sanno i draghi sul destino di questo mondo? E che cosa ha da fare il piano del Professor Twiddles per ripristinare i portali con tutto questo? Per scoprire il suo destino, il nostro eroe deve acquisire nuove abilità e combattere contro nemici nuovi e vecchi. Ma ovunque vada, i Nameless sembrano sempre avere un passo avanti, e si scatenano battaglie vane in cui l'eroe tiene tra le mani il destino di tutta Eo.