Aliens Versus Predator: Extinction è un videogioco di strategia in tempo reale che presenta tre diverse specie, tutte in competizione per il controllo del pianeta LV-742. I giocatori possono comandare una forza d'élite di Colonial Marines, inseguire la loro preda come membro del clan Predator, o strisciare in branco come gli Aliens che sputano acido. Il gameplay implica progredire attraverso una serie di missioni ambientate in scenari che vanno dalle giungle e caverne a campi di battaglia futuristici e colonie spaziali. Ogni fazione offre dieci tipi di unità di combattimento che possono essere aggiornate nel tempo con nuovi attributi o equipaggiamenti specifici per la specie. I Predators, ad esempio, aumentano il numero delle loro modalità di visione, gli Aliens impregnano le loro vittime con facehuggers, mentre i Colonial Marines ricevono nuovi miglioramenti alle armi. Come in titoli come StarCraft, le unità variano da normali soldati e fanteria a forze specializzate e massicci trasporti di truppe.