Game: Clock Tower 3 La storia ruota attorno a una ragazza di nome Alyssa Hamilton, che sembra "viaggiare nel tempo" nel passato entrando in regni. In questi regni, è inseguita da serial killer psicopatici e sadici. Nel corso del viaggio, scopre oscuri segreti sulla sua storia familiare e porta pace alle vittime tormentate oltre la tomba. Il gioco è ambientato nel 2003 a London, England. Durante il gioco, Alyssa esplorerà una villa, una città in rovina, una sala da concerto, una fabbrica sotterranea e fognature, un cimitero, un ospedale abbandonato e un castello con una torre dell'orologio.