Il gioco è ambientato nella terra immaginaria di Ivalice, dove gli imperi di Archadia e Rozarria conducono una guerra infinita. Dalmasca, un piccolo regno, è intrappolata tra le nazioni belligeranti. Quando Dalmasca viene annessa da Archadia, la sua principessa, Ashe, crea un movimento di resistenza. Durante la lotta, incontra Vaan, un giovane avventuriero che sogna di comandare un dirigibile. Vengono presto raggiunti da una banda di alleati; insieme si uniscono contro la tirannia dell'Impero Archadiano.