Il capitolo inizia con Gina e Colette che arrivano al Dipartimento di Materiali Anomali proprio in orario, in contrasto con Gordon che è in ritardo in Half-Life. Sono accolti da una guardia di sicurezza, la quale commenta che oggi è «il grande giorno» e che workanno con il «nuovo ragazzo, Dottor Freeman». Spiega anche che un recente crash di sistema potrebbe averli cancellati dal sistema di sicurezza, quindi dovranno accedere nuovamente nella stanza successiva. Dopo essere stati scansionati e reinclusi nel sistema di sicurezza, i due dottori si dirigono verso la sala di controllo dei Materiali Anomali. Il Dottor Keller li saluta ma mostra il suo fastidio per il ritardo di Freeman, dicendo «non capisce cosa Kleiner veda in quel ragazzo». Il Dottor Rosenberg entra quindi nella sala di controllo e esprime la sua disapprovazione per lo che l’Anti-Mass Spectrometer venga spinto a una potenza così alta per l’analisi. Tuttavia cede dopo che il Dottor Keller dice che non è sua decisione e se non desidera vedere l’esperimento può tornare nei suoi piccoli laboratori vicino al deposito ferroviario. Cross e Green scendono nelle rispettive aree per l’esperimento. Gina va allo scivolo di caricamento per spingere il campione fino a Gordon, e Colette entra nell’area inferiore della camera di prova per accendere l’alimentazione e impostarla all’80%. Dopo che Gina risolve un piccolo problema in cui un piede di porco era misteriosamente bloccato all’interno del meccanismo dello scivolo di caricamento, il campione viene portato da Freeman e si verifica la Cascata di Risonanza. Cross e Green perdono conoscenza per un periodo di tempo e si risvegliano vedendo la parte inferiore della camera di prova in macerie. Sentono il Dottor Keller e Rosenberg sull’altoparlante discutere su cosa fare. Il Dottor Rosenberg è determinato a salvare il personale della struttura, mentre il Dottor Keller vuole riparare la fenditura creata dalla Cascata di Risonanza, affermando che hanno causato questo pasticcio e dovrebbero essere responsabili di sistemarlo. Dopo aver trovato pistole e aver fatto strada attraverso una parte del laboratorio, i due dottori tornano nella sala di controllo. Keller e Rosenberg comunicano loro di aver raggiunto un accordo. Accompagneranno il Dottor Rosenberg in superficie per chiamare i militari, e Keller rimarrà al di sotto per valutare i danni causati all’attrezzatura. Con un po’ di fortuna, sarà in grado di scoprire cosa ha causato il malfunzionamento dell’esperimento e come porre rimedio. Il Dottor Cross, Green e Rosenberg entrano nell’ascensore per risalire in superficie attraverso l’Hazard Course, e la missione termina.