Lupine III e i suoi inseparabili compagni Jigen e Goemon corrono in aiuto della bellissima Fujiko, che si è messa nei guai: la donna è infatti stata rapita dalla banda del Celestial Dragon, agli ordini del crudele Kourin, un terribile ventenne con tecniche di lotta ineguagliabili e abile interprete di misteriose arti marziali, che colpisce Lupine in un punto vitale con il letale Dark Blow, lasciando al ladro gentiluomo solo tre giorni di vita. Per salvarsi, Lupine deve impossessarsi del tesoro di Sokai (si dice che nel tesoro ci sia una cura in grado di guarire dal Dark Blow), attraverso una serie di indizi scritti nel Libro, alias i Pink Crystals (accompagnati dai Black Crystals nella seconda linea narrativa del gioco), che però sono il premio in palio per la vincitrice della competizione Miss Sokai. Fujiko si iscrive al concorso di bellezza, ma nasce un problema: è la bellissima Ginrei, una ragazza così affascinante da suscitare persino l’ammirazione dell’impassibile Goemon. Come se non bastasse, l’ispettore Koichi Zenigata, acerrimo nemico di Lupine III, intuisce che il prossimo obiettivo del protagonista saranno i Pink Crystals e allora si precipita da Ginrei per avvertirla di Lupine e per sorvegliarla al fine di mantenerla al sicuro. Il primo incontro tra Zenigata e Ginrei non è dei migliori: lei lo invita ad allontanarsi da sé perché la giovane è convinta di trovarsi al di fuori di ogni pericolo, mentre lui la considera una ragazza vanitosa e figlia di papà (non sapendo che in realtà la giovane proviene dalle periferie di Sokai, un quartiere molto poco affidabile e soprattutto molto povero). Intanto, temendo che Ginrei possa togliere a Fujiko il titolo di vincitrice, Lupine trama di intrufolarsi nell’hotel della ragazza per somministrarle di nascosto una dose di sonnifero che la farebbe dormire per due giorni. Ma poiché Zenigata era lì a sorvegliare la ragazza, l’astuto ladro gentiluomo viene scoperto due volte (prima nel ristorante dove Zazzà e la ragazza avevano cenato, poi nell’appartamento della giovane dopo che Lupine era riuscito a sfuggire a tutte le guardie di polizia presenti), ma entrambe le volte riesce rapidamente a scappare. Nel frattempo, il rapporto tra Ginrei e Zenigata sta notevolmente cambiando: tra i due nasce un accordo, Zazzà non pensa più che la giovane sia solo una presuntuosa egoista, mentre quest’ultima vede nell’ispettore una figura che la protegge ed è sempre al suo fianco nei momenti di bisogno. In altre parole, la scintilla dell’amore cominciò a accendersi. Il giorno della gara di Miko arriva: Fujiko e Ginrei sfilano sulla passerella con eleganza e, soprattutto, seduzione impareggiabile. Ma tra le due è Fujiko a rubare la scena, senza dubbio più disinvolta e sexy dell’avversaria, decisamente più timida e riservata. Armati quindi di Cristalli Rosa e della benedetta Miko (Fujiko), Lupine e la donna si affrettano a raggiungere il Palazzo del Governo di Sokai dove si dice sia nascosto il tesoro. Il protagonista sfugge a tutte le trappole e insidie nascoste dall’edificio; nel frattempo Zenigata cerca di improvvisare un discorso per consolare Ginrei, quando all’improvviso lei sente di parlare con Kourin, l’architetto del Colpo Oscuro che ha condannato Lupine a soli tre giorni di vita. Zazzà scopre che Kourin è nientemeno che il fratello di Ginrei, che voleva che la sua dolce sorella vincesse la gara di Miko per ottenere i Cristalli Rosa che condurrebbero il terribile ragazzo al tesoro di Sokai. L’ispettore irrompe nella stanza in cui Kourin e Ginrei stanno conversando, ma il capo del Celestial Dragon spara traditramente al povero Zenigata, che fortunatamente riesce a salvarsi grazie al giubotto antiproiettile che indossava per proteggere, se necessario, Ginrei. Kourin dunque si precipita al Palazzo del Governo per impedire a Lupine di impossessarsi del tesoro; il capo del Celestial Dragon raggiunge Fujiko e il protagonista, e informa quest’ultimo del fatto che la medicina in grado di guarire dal Colpo Oscuro è la cosiddetta Fog Flower, un fiore, in realtà, capace di eliminare totalmente gli effetti del terribile colpo uccisore. Per fermare il ladro dall’andare oltre, tuttavia, Kourin colpisce Fujiko con il tremendo Colpo Oscuro, scatenando l’ira di Lupine che, furioso come sempre, uccide il capo del Celestial Dragon tramite i colpi del suo infallibile Walther P38 (nel secondo e ultimo atto della saga, invece, sarà Zenigata a mettere fine a Kourin, per vendicare le sofferenze che quest’ultimo provocò a sua sorella Ginrei). Lupine così riesce a impossessarsi del Fog Flower, facendole bere l’unica goccia purificatrice, che si ristabilisce e riesce a scorgere a stento il volto sorridente del ladro, che cade apparentemente privo di vita a terra. Fortunatamente, la donna bacia il protagonista per ringraziarlo di averle salvato la vita.