La protagonista è una normale ragazza delle superiori che frequenta Melrose Girls' Academy ad Arcadia. Un giorno è visitata da un gentiluomo di nome Nyx e scopre di avere il potere dormiente di purificare Thanatos, o mostri incorporei che predano l'uomo comune. Lascia la sua vita scolastica per unirsi all'attività di esterminio di Thanatos gestita da Nyx: "Aube Hunters". Presto si rende conto di essere l'unica ragazza dotata di poteri di purificazione, poiché è la Queen Egg, spesso favoleggiata, o una salvatrice leggendaria. Il suo obiettivo è lavorare insieme ai suoi compagni di Aube Hunters per eradicare Thanatos e riportare la pace sulla terra.