Mike LeRoi — il protagonista amareggiato dell'originale Shadow Man è incaricato, ancora una volta, di salvare Liveside e il mondo parallelo Deadside. In questo action-adventure in terza persona, un culto di demoni noto solo come i Grigori (e che, tra l'altro, si è mascherato da umano negli ultimi 2000 anni) è intenzionato a resuscitare il loro maestro, Asmodeus. Farlo provocherà una fine catastrofica per tutta l'umanità. Sia Mike LeRoi che il suo alter ego Shadow Man, i giocatori devono esplorare sei mondi; ciascuno con numerose località secondarie, nel loro tentativo di impedire a queste creature malvagie di portare a compimento il loro piano diabolico. Durante il combattimento, Mike LeRoi può attaccare con una vasta gamma di armamenti, che va da potenti armi da proiettili a armi da corpo a corpo a corta distanza, con cui colpire a morte un avversario. Inoltre, è possibile per i giocatori equipaggiare un'arma diversa in ogni mano, oppure equipaggiare un'unica arma pesante a due mani. Quando sono impugnate da Shadow Man stesso, le armi assumono proprietà aggiuntive. Un cursore di mira automatica può essere usato per mirare bersagli specifici, permettendo al giocatore di schivare e attaccare con estrema facilità. Nel corso del gioco ci sono enigmi che devono essere risolti affinché Shadow Man possa progredire attraverso i mondi. Durante l'intero viaggio, Mike sperimenterà condizioni meteorologiche e temporali in costante mutamento; il giorno passerà a notte e viceversa in tempo reale, con maltempo che predomina in molte parti del mondo di gioco. Tornano in scena Mama Nettie e Jaunty, due dei compagni di Shadow Man dall'originale titolo, mentre Thomas Deacon, il custode su sedia a rotelle di un antico libro che i Grigori stanno inseguendo, fa la sua prima apparizione. Shadow Man: 2econd Coming presenta temi maturi e violenti che toccano argomenti quali religione e voodoo. Le sequenze cinematiche presentano dialoghi tra i personaggi altrettanto orientati agli adulti.