The Clone Wars ti mette nel mezzo delle battaglie dell'Antica Repubblica attraverso 16 missioni, pilotando una gamma di veicoli tra cui speeder bikes, Republic Gunships e carri armati da combattimento, nonché l'arma dei Jedi, la tua spada laser, per il combattimento ravvicinato. Mentre la serie Rogue Squadron si concentrava sui combattimenti aerei, The Clone Wars comprende quasi tutte le battaglie a terra. Devi combattere nei panni di Anakin Skywalker, Obi Wan Kenobi, Mace Windu e altri durante tutto il gioco per impedire alla Confederazione di ottenere un'arma letale. Le opzioni multiplayer sono anche incluse per un massimo di quattro giocatori, con tipologie di gioco tra cui deathmatch, conquista e una modalità cooperativa di sopravvivenza su terreno e veicoli.