I giocatori interpretano uno dei tre sopravvissuti: l'equilibrato Kenji, la veloce Abbie o il combattivo Jack — naufraghi su una delle quattro isole infestate da zombi che formano un arcipelago. Dopo aver trovato cibo per un altro sopravvissuto ferito, Andrew (che ha già subito una morsicatura di zombi), il sopravvissuto incontra un vecchio uomo con una gamba sola di nome Ramon, che possiede una barca che può essere usata per viaggiare tra le isole. Insieme escogitano un piano per fuggire dall'arcipelago usando un idrovolante arenato, con Andrew come pilota. Ramon invia il sopravvissuto a recuperare materiali per riparare l'aereo. Il sopravvissuto incontra presto Kovac, un misterioso uomo in armatura completa che ha fatto delle isole la sua zona di caccia privata. Autoproclamatosi maestro sopravvissuto, Kovac usa la sua vasta esperienza sul campo per scrivere una guida sulla sopravvivenza agli zombi ('Kovac's Rules'), e accetta volentieri un ruolo di mentore, aiutando il sopravvissuto con consigli e strumenti preziosi nel corso del gioco.