In inFAMOUS 2, esistono persone con abilità superumane, chiamate Conduits. Dalla creazione del primo Conduit, Cole MacGrath, l'emergere di altri ha destabilizzato la società umana. Allo stesso tempo, Cole ha appreso dal suo sé futuro, Kessler, che un potente Conduit noto come la "Beast" sorgerà per distruggere il mondo e che solo lui ha il potere di sconfiggerlo.
Storia
In seguito agli eventi di InFAMOUS, Cole (Eric Ladin) e il suo amico Zeke (Caleb Moody) incontrano l'agente della NSA Lucy Kuo (Dawn Olivieri), la quale informa loro che il Dr. Sebastian Wolfe (Michael Ensign), l'uomo responsabile di aver creato la Ray Sphere che ha conferito a Cole i suoi poteri, ha sviluppato una versione ancora più potente che gli darebbe abbastanza forza per fermare la "Beast". Prima che possano partire per il laboratorio di Wolfe a New Marais, la "Beast" attacca Empire City. Cole cerca di respingerlo, ma anche il suo attacco più potente si rivela inutile. Il gruppo è successivamente costretto a fuggire poiché Empire City è completamente e totalmente distrutta.
Arrivando a New Marais, Cole e i suoi alleati apprendono che l'imprenditore energetico Joseph Bertrand III (Graham McTavish), un demagogo anti-Conduit, ha preso il controllo della città. Consapevole delle intenzioni di Wolfe, Bertrand ha la sua armata privata, la Militia, a distruggere il laboratorio del dottore. Soccorrendo Wolfe, Cole scopre che ha sviluppato il Ray Field Inhibitor, un dispositivo in grado di privare i Conduits dei loro poteri. Prima che possa aiutare Cole a localizzare i nuclei energetici necessari per alimentare il RFI, viene ucciso dalla Militia, che prende anche Kuo prigioniera. Mentre cerca di liberarla, Cole e Zeke incontrano Roscoe Laroche, un veterano del Vietnam che guida un movimento di resistenza opposto a Bertrand, e Nix (Nika Futterman), una Conduit in grado di manipolare e incendiare una sostanza nera simile al napalm, che ha condotto una guerra contro la Militia. Utilizzando le informazioni raccolte da Zeke, Cole e Nix individuano un laboratorio segreto dove Kuo, rivelata essere una Conduit, è stata costretta a trasferire i suoi poteri generatori di ghiaccio a un esercito di mercenari umani controllati da Bertrand. I due la liberano, ma finiscono anche per liberare mercenari mentalmente instabili nella città.