La storia ufficiale fornita da Eolith è la seguente:
"Un'intera città è stata spazzata via dal globo con l'uso dell'arma satellitare, Zero Cannon, durante King of Fighters 2000.
Questo incidente è stato riportato come risultato di un satellite artificiale che precipitò sulla Terra, e adornò le prime pagine di vari quotidiani di paesi di tutto il mondo.
Una legione di individui chiese la fine del torneo KOF, che sembrava sempre invitare qualche tipo di incidente, ma ironicamente questo torneo di combattimento con una brutta storia una volta di più riacquistò una notevole popolarità.
L'interesse per il torneo ha eguagliato quello del concorso del '97; anzi, forse lo superò.
Ma per questo torneo svolto sulla scena internazionale, è venuto alla luce un fatto sorprendente.
Una squadra di NESTS è entrata nel torneo!
Quali sono i veri obiettivi dello sponsor dell'evento? Non c'è alcuna garanzia che neanche con questo torneo la tragedia non si ripeta...
Il terzo capitolo della serie King of Fighters: The NESTS Chronicles. Finalmente, questo torneo metterà fine a tutto!"
Il cartello NESTS decide di ospitare il torneo KOF 2001 in modo da poterlo usare come mezzo per eliminare i loro nemici e far entrare la propria squadra tra le file.
Nelle finali del torneo, la Hero Team sale su un dirigibile speciale che si rivela presto essere una navetta spaziale. Lì incontrano Original Zero, la cui clone ha decimato la segretezza dei cartelli con il suo piano nell'anno precedente. Li congratula per aver raggiunto le finali e afferma che si dirigono verso la vera sede di NESTS. Decide di intrattenere i suoi passeggeri con un incontro ed è supportato dal suo leone nero domestico Glugan, Ron e Krizalid. Nonostante la forza opprimente del suo gruppo, viene sconfitto pochi istanti prima che la nave attracchi al satellite di NESTS nello spazio. Rimane a bordo della nave in esplosione e incita la Hero Team ad andare avanti.
Una volta all'interno del satellite di NESTS, affrontano il leader di NESTS, Nests. Esprime desideri che i suoi agenti rinnegati ritornino nell'organizzazione ed è poco dopo ucciso da Igniz, che rivendica la proprietà del cartello. Igniz rivela anche che K', Kula, Krizalid, K9999 e Whip sono cavie/creazioni fatte per il suo intrattenimento personale. Kula, che era stata separata dal resto della sua squadra e presente all'epoca, ha anche scoperto la sua origine come forma di vita artificiale. Dichiara se stesso dio, egli attacca la squadra come primo atto di "divina retribuzione" e li sconfigge. Appena sta per uccidere K', altri combattenti intervengono e aiutano nella lotta, tra cui tutti i capi della squadra, Kyo e Iori. Quando viene sconfitto, proclama di essere un dio decaduto e si autodefinisce un "demonio" invece. Spinge il satellite attraverso l'atmosfera terrestre nel tentativo di demolire la sua concorrenza.
Per fortuna, il satellite si schianta sull'oceano e i combattenti a bordo sono stati in qualche modo salvati dall'esplosione, presumibilmente grazie a Ron. K' salva Kula dall'annegamento; in gratitudine, lei e la sua guardiana, Diana, si alleano con K' e con la compagnia. K9999 e Angel sono presumibilmente ancora vivi anche se i loro esatti spostamenti sono sconosciuti. Foxy viene anch'essa pugnalata da loro, sebbene la sua apparente morte in scena sia successivamente rivelata falsa."