L'agente GRE sotto copertura Kyle Crane viene paracadutato a Harran per recuperare un file sensibile rubato da Kadir Suleiman, che lo usa per ricatti. Crane viene morso da un infetto, sebbene venga salvato da Jade Aldemir e portato a un rifugio per sopravvissuti chiamato Tower. Crane viene presentato a Rahim Aldemir, il fratello minore di Jade, che gli insegna le basi del parkour. Crane apprende che la Tower è tormentata da una banda di predoni guidata da un signore della guerra chiamato Rais, che ruba e accumula provviste dagli airdrops GRE. Questo include Antizin, una droga che rallenta la progressione dell'infezione e sopprime i suoi sintomi. Crane è incaricato di raggiungere un airdrop contenente l'Antizin estremamente necessario, ma il GRE gli ordina di distruggere l'airdrop e, invece, comprare il farmaco da Rais per confermare la sua identità. Crane acconsente riluttante e mente a Tower dicendo che le forniture sono state saccheggiate. Infastidito, il leader della Tower, Harris Brecken, incarica Crane di negoziare un accordo con Rais. Incontrando Rais, Crane è in grado di confermare che lui è davvero Suleiman. Crane compie una serie di compiti poco etici per Rais credendo che gli verrà ricompensato con due casse di Antizin, ma Rais lo tradisce dando solo cinque fiale. Più tardi taglia i rapporti con il GRE quando essi interrompono le consegne di rifornimenti e si rifiutano di aiutare la Tower. Disperati di ottenere Antizin, Crane e Jade assaltano il magazzino di Rais ma trovano invece una riserva di esplosivi plastici. Rahim tenta di usare gli esplosivi per bombardare un nido di Volatile, nonostante l'obiezione di Crane. Rahim viene ferito, e Crane esegue il piano di Rahim e distrugge tutti gli infetti nel nido. Tuttavia, al ritorno, scopre che Rahim era in realtà morso e si era trasformato in un infetto mentre Crane era via, costringendo Crane a ucciderlo. Nel frattempo, uno scienziato della Tower di nome Dr. Imran Zere, che stava tentando di sviluppare una cura per il virus, viene rapito da Rais. Crane tenta un salvataggio ma viene anch'esso catturato. Rais rivela che il file che ha rubato contiene la prova che il GRE intende armare il virus piuttosto che sviluppare una cura. Nel tentativo di fuggire, Crane taglia la mano a Rais. Dr. Zere viene ucciso dopo aver detto a Crane che aveva incaricato Jade di consegnare la sua ricerca allo scienziato Dr. Allen Camden. Mentre Crane cerca Jade, scopre che il Defence Ministry sta pianificando di lanciare un bombardamento su Harran nel tentativo di eradicare l'epidemia, sostenendo che non ci sono sopravvissuti. Lavorando con gli Embers, un gruppo di sopravvissuti nell'Old Town, Crane cerca di avvisare il mondo esterno facendo esplodere bombe in un edificio di un palazzo nella configurazione di una faccia triste, ma un jet spara un missile che oscura lo schema. Crane riattiva quindi una torre radio e avvisa con successo il mondo esterno degli sopravvissuti a Harran, sventando il piano del Ministry. In uno sforzo disperato per evitare scandali, GRE contatta Crane per recuperare la ricerca di Dr Zere per loro in modo da poter convincere il pubblico che stanno lavorando sulla cura; in cambio lo estrarranno in salvo da Harran.