Sly Cooper proviene da una lunga stirpe di maestri ladri (il Clan Cooper) che rubano solo ad altri criminali, diventando così vigilanti. L'eredità della famiglia Cooper, un antico libro chiamato The Thievius Raccoonus, registra tutte le mosse segrete e le tecniche di ogni membro del clan. Nel suo ottavo compleanno, Sly avrebbe dovuto ereditare il libro e imparare tutti i segreti antichi della sua famiglia, che avrebbero dovuto aiutarlo a diventare un maestro ladro; tuttavia, un gruppo di sgherri dal nome "The Fiendish Five" (guidati da Clockwerk, che è l'arcinemico della famiglia) attacca la casa dei Cooper, uccide i genitori di Sly e ruba tutte le pagine del Thievius Raccoonus. Dopo di ciò, la banda spietata prende strade diverse per commettere crimini diabolici in tutto il mondo. Sly viene mandato in un orfanotrofio dove incontra due ragazzi che diventano i suoi migliori amici per sempre e forma una banda con loro: Bentley, un tecnico, inventore e talentuoso hacker matematico con una conoscenza enciclopedica che ricopre il ruolo di cervello della banda, e Murray, un enorme tipo husky, codardo, con un appetito gigantesco che interpreta il ruolo dei muscoli e del conducente della banda. I tre lasciano l'orfanotrofio insieme all'età di 16 anni per iniziare la loro vita diventando criminali vigilanti internazionali, chiamandosi "The Cooper Gang". Sly giura che un giorno vendicherà la sua famiglia e rintraccerà i Fiendish Five per riappropriarsi del Thievius Raccoonus. Due anni dopo, il Cooper Gang si dirige a Parigi, Francia, per infiltrarsi in Itnerpol (la sede di polizia) al fine di trovare il file segreto della polizia che contiene dettagli e informazioni sui Fiendish Five, ma durante il colpo sono sorpresi dall'ispettore Carmelita Fox (nei confronti della quale Sly sviluppa una attrazione romantica), un ufficiale di polizia affiliato con Interpol e che sta dando la caccia al Cooper Gang. La banda riesce a impadronirsi del dossier della polizia e a fuggire con successo da lei e dal resto degli ufficiali. Con il dossier segreto finalmente tra le loro mani, il Cooper Gang riesce a rintracciare i Fiendish Five.