Fallen Ghosts si svolge dopo la caduta del Santa Blanca Cartel. Con la forza militare della Unidad incapace di mantenere il controllo sulla Bolivia, il paese è in uno stato di guerra civile. Per aiutare a ristabilire l'ordine, la Unidad arruola membri del cartello, veterani, mercenari e criminali provenienti da vari paesi vicini come volontari. Insieme, formano una nuova brutale unità speciale: Los Extranjeros, a cui viene ordinato di rintracciare ed eliminare tutti gli agenti americani. In questa situazione caotica, i Ghosts hanno una missione finale: evacuare gli ultimi membri della CIA e i civili americani rimasti nel paese. Abbattuti lungo la strada verso la loro missione, i Ghosts si ritrovano in mezzo alla giungla, senza supporto esterno, affrontando nemici mortali equipaggiati con le ultime attrezzature e tecnologie. La campagna Fallen Ghosts presenterà 15 nuove missioni in cui i giocatori dovranno eliminare quattro nuovi boss situati in tre diverse regioni. Nell'espansione, i giocatori inizieranno con un nuovo personaggio al livello 30 e dotato di tutte le principali abilità del gioco. Il limite di livello passerà da 30 a 35, e i giocatori potranno sbloccare nove nuove abilità, tra cui quelle fisiche, legate alle armi e ai droni. Fallen Ghosts presenta anche sei nuove armi esclusive, che spaziano da fucili d'assalto, fucili di precisione e una balestra che può essere equipaggiata con frecce esplosive. Infine, i giocatori più hardcore saranno lieti di sapere che le difficoltà avanzate ed esperte sono state modificate per offrire una sfida ancora maggiore. Disattivando l'HUD, i giocatori avranno l'esperienza più estrema e tattica possibile in Ghost Recon Wildlands.