Console portatili contro smartphone — la rivoluzione portatile delle piccole sorelle che è iniziata col passare del tempo… Quel giorno, i quattro CPU partirono in risposta a una richiesta di aiuto dal PC Continent, ben oltre il mare, mentre Nepgear e gli altri candidati CPU che rimasero indietro visitavano un determinato centro di ricerca. Là, furono intrappolati in una capsula e messi in un sonno profondo dal 'Gray CPU', e si risvegliarono in Gamindustri due anni dopo. Le persone ora avevano l'ultimo modello di smartphone, chiamato lo 'MagiPhone'. Divenne un mondo in cui la quota di mercato era dominata dagli smartphone. A Nepgear si dice che Planeptune sia caduta vittima del 'Buzzoer Phenomenon', nel quale apparivano orde di mostri, e che sua sorella maggiore Neptune fosse scomparsa. Avendo perso sua sorella e una casa a cui tornare, Nepgear cadde nella disperazione. Questa è una storia di distruzione e ricostruzione, da CPU, per CPU, per spianare la strada da un futuro di disperazione a un futuro di speranza.