Nel 2020, la protagonista e i suoi amici d'infanzia si preparano alle vacanze di Natale. Mentre salgono a bordo di un aereo per tornare in Giappone, vengono risucchiati nel mondo parallelo. Questo mondo sta vivendo la turbolenta fine dello shogunato Tokugawa nel dicembre del 1863. Usando una clessidra magica, ella ottiene il potere instabile di viaggiare in entrambi i mondi. Anche se lei e i suoi compagni oscillano dentro e fuori dal mondo parallelo, le sue avventure in questo mondo si estendono per un totale di tre anni. All'inizio, la protagonista desidera salvare i Four Gods dalle fazioni belliche del mondo parallelo, al fine di salvare il suo mondo natale misteriosamente devastato. Col passare del tempo, scopre che entrambi i mondi si stanno fondendo per creare un altro mondo. Sperando di impedire le morti forzate di due mondi, lei sacrifica volentieri frammenti della sua stessa forza vitale per proteggere i suoi cari.