Il gioco si svolge durante la Second Europan War. Gallian Army Squad 422, conosciuta anche come "The Nameless", è un'unità militare penale composta da criminali, desertori stranieri e autori di infrazioni militari i cui nomi reali sono cancellati dai registri e di conseguenza sono ufficialmente identificati dai numeri. Ordinata dall'esercito Galliano a svolgere le missioni più pericolose che l'Esercito Regolare e la Milizia non intraprenderanno, la 422nd è tuttavia all'altezza del compito, come esemplificato dal suo motto, Altaha Abilia, che significa "Sempre Pronto."
I tre protagonisti sono No.7 Kurt Irving, un ufficiale dell'esercito falsamente accusato di tradimento che desidera redimersi; Ace No.1 Imca, una specialista femmina di armi pesanti Darcsen che cerca vendetta contro la Valkyria che ha distrutto la sua casa; e No.13 Riela Marcellis, una giovane donna apparentemente sfortunata che non sa di essere lei stessa una Valkyria.
Insieme agli altri membri della squadra, questi tre hanno il compito di combattere contro una misteriosa unità imperiale, principalmente Darcsen, nota come Calamity Raven.
Poiché i Nameless ufficialmente non esistono, i vertici dell'Esercito Galliano sfruttano il concetto di deniabilità plausibile per inviarli in missioni che altrimenti farebbero perdere faccia a Gallia durante la guerra. Seppure a volte ciò funzioni a loro favore, come nel caso di un'incursione riuscita nel territorio imperiale, altri ordini causano a certi membri della 422nd un grave turbamento. Uno di tali membri, Gusurg, diventa talmente furioso da abbandonare la sua postazione e defezionare nelle file di Calamity Raven, legato all'ideale di indipendenza Darcsen proposto dal loro leader, Dahau. Contemporaneamente, elementi del comando dell'Esercito Galliano si muovono per cancellare i Nameless al fine di proteggere i propri interessi. Inseguiti sia dagli alleati che dai nemici, e complicati dalla presenza di un traditore tra le loro fila, la 422nd si muove disperatamente per restare in vita, mentre allo stesso tempo combattono per contribuire allo sforzo bellico galliano. Questo continua finché il comandante dei Nameless, Ramsey Crowe, che era stato tenuto agli arresti domiciliari, non viene accompagnato nella capitale Randgriz per presentare prove che scagionino i soldati stanchi e smascherino il vero traditore, il generale Galliano che aveva accusato Kurt di tradimento.
