Sarge's Heroes 2 inizia dove è rimasto Sarge's Heroes. Si annuncia che la cattura di Field Marshal Tannenberg porrà fine alla guerra. Poiché Generale Plastro è scomparso, si suggerisce che sia diventato vittima della plastrificazione ed sia rimasto intrappolato nel mondo reale. Il gioco introduce Bridgette Bleu, una spia per la Blue Nation. Ha sviluppato un siero che inverte la plastrificazione. Il tuo compito, come Sarge e a volte Vikki, è distruggere il siero, eliminare i soldati Tan e catturare Plastro e Tannenburg.