Game: Samurai Deeper Kyo L'adattamento manga e anime segue la storia di Demon Eyes Kyo mentre cerca di riottenere il suo corpo, dopo che la sua anima è stata sigillata nel corpo del suo rivale, Mibu Kyoshiro. Kyo è accompagnato nella sua ricerca dal cacciatore di taglie Shiina Yuya, dall'erede allo shogunato Tokugawa Benitora e da Sanada Yukimura, un noto rivale dei Tokugawa.