È stato scoperto un decimo pianeta, molto oltre Plutone. L'umanità ha temporaneamente chiamato questo misterioso pianeta, che è apparso improvvisamente Number Ten. Dalla Terra sono state avviate varie indagini, ma non è stato possibile ottenere dati dettagliati su questo misterioso pianeta. La Terra continua a indagare Number Ten, ma sta per scatenarsi un invaso malvagio terrificante che si estenderà da migliaia di stelle fluttuanti nello spazio... L'umanità, consapevole di ciò, ha organizzato due organizzazioni per mezzo di una risoluzione delle Nazioni Unite e ha tentato di contrastare l'inimico straniero. Earth Defense Force e Terrestrial Defense Force (comunemente nota come "TDF"), che si occupano principalmente della sfera terrestre, e Space Investigation and Defense Organization (comunemente nota come "SIDO"), che si occupava della parte esterna del sistema solare a partire da Marte, erano responsabili della difesa della Terra. Mentre si preparava per un'invasione dallo spazio esterno, SIDO lanciò nello spazio Nagar, una nave-fortezza spaziale all'avanguardia, al fine di indagare segretamente Number Ten. Tuttavia, i contatti con Nagar si interruppero e, nonostante le indagini sul suo paradero, non riuscirono a trovarlo. Tre anni dopo, Number Ten scomparve improvvisamente senza lasciare traccia. Scienziati sulla Terra hanno dibattuto di tutto ciò che riguarda l'identità di Number Ten, ma il tempo è passato senza una risposta definitiva. Sulla Terra, dove le invasioni dallo spazio esterno stavano per intensificarsi, la TDF e la SIDO furono integrate al fine di unificare la catena di comando, e vennero organizzate diverse organizzazioni di ricerca per la difesa sulla Terra, con il nuovo TDF in testa. Tuttavia, l'umanità non si è ancora accorta che i germogli del male hanno iniziato a germogliare anche sulla Terra stessa. E dodici anni stavano per passare...